潭柘寺的大雄宝殿也是必须打卡的一个建筑 ，是整个潭柘寺最雄伟壮丽的建筑。它和故宫太和殿的造型完全一样，“重檐庑殿顶、四面坡、八面流水、九个房脊，”都是清朝最高等级的建筑。屋顶上的瓦是黄色的，黄瓦是皇家专利。一般的寺庙都是绿瓦、蓝瓦和灰瓦。但是潭柘寺的大殿使用的却是黄瓦，可见潭柘寺的地位之高。

另外潭柘寺的大雄宝殿，还有一个特殊之处，屋顶使用的是“井口天花”，这种形式的天花板只有在皇宫的正殿里才可以用，就连偏殿、配殿都不能使用，而潭柘寺的大雄宝殿却有这种特权，这在中国所有的寺庙中也是极为特殊的。

走过大雄宝殿，有两棵镇寺千年银杏分立中轴线两旁。东边的是唐代种植、乾隆御封的“帝王树”，1300年的树龄，高30多米。

潭柘寺的二乔玉兰堪称京城一绝，植于明代，距今已有400余年历史，极其珍贵。寺中的玉兰为紫、白双色，极其罕见。